Cython Notes

教程

官方 Tutorial
- 官方入门

编译单个文件

制作 setup.py

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from setuptools import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(
    ext_modules = cythonize("helloworld.pyx")
)

这里假设我们要处理的脚本是 helloworld.pyx

命令行执行
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python setup.py build_ext --inplace

直接使用 .pyx 模块

需要添加的代码

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>>> import pyximport; pyximport.install()
>>> import helloworld
Hello World

编译多个模块（文件）的项目

参考
- https://stackoverflow.com/questions/11507101/how-to-compile-and-link-multiple-python-modules-or-packages-using-cython

设置多个 Extension

例子

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setup(
    cmdclass = {'build_ext': build_ext},
    ext_modules = [Extension("example", sourcefiles), Extension("example2", sourcefiles2), Extension("example3", sourcefiles3)]
)

梯级项目结构 PackageHierarchy

cython 官方 github
- https://github.com/cython/cython/wiki/PackageHierarchy

因 Cython 编译 pyd 造成 ZeroDivisionError

参考
- https://stackoverflow.com/questions/46028449/cython-float-division-error-zero-division-numbers-too-big-or-too-small
因为 cython 把数转换成 c/c++ 类型
- 导致很小的数，识别成 0
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  result = - self.get_deltaG(temp, extrapolate) / (10**-3 * CONSTANT_R * temp)
  - 解说
    - 这里 10**-3 是一个很小的数
      - 在转换成 c/c++, 可能被认为是对整型操作
      - 取整，保持了零
    - 正确做法
      - 把 10**-3 —> 换成 10.0**-3
      - 浮点数操作
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        result = - self.get_deltaG(temp, extrapolate) / (10.0**-3 * CONSTANT_R * temp)

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教程

编译单个文件

直接使用 .pyx 模块

编译多个 模块（文件） 的项目

设置多个 Extension

梯级 项目结构 PackageHierarchy

因 Cython 编译 pyd 造成 ZeroDivisionError

编译多个模块（文件）的项目

梯级项目结构 PackageHierarchy